Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pola2P33611 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pola2P33611 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms