Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms