Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms