Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc10P31257 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms