Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Hoxd10P28359 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hoxd10P28359 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Hoxd10P28359 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Hoxd10P28359 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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