Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms