Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms