Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms