Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms