Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx3P23198 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms