Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms