Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f1P21952 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms