Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SagP20443 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SagP20443 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SagP20443 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SagP20443 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SagP20443 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SagP20443 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SagP20443 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SagP20443 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SagP20443 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms