Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VimP20152 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VimP20152 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VimP20152 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VimP20152 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VimP20152 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VimP20152 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VimP20152 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VimP20152 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VimP20152 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VimP20152 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VimP20152 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms