Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NelfeP19426 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NelfeP19426 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms