Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama1P19137 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lama1P19137 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms