Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpraP18052 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtpraP18052 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms