Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms