Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f1P17208 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms