Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sptan1P16546 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms