Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms