Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf1P15314 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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