Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dnmt1P13864 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dnmt1P13864 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms