Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms