Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga5P11688 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga5P11688 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms