Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms