Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spp1P10923 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spp1P10923 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms