Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms