Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb4P10284 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms