Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp28P10078 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms