Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms