Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnmt3cP0DOY1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms