Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms