Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 463.5 ms