Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms