Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NeflP08551 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NeflP08551 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NeflP08551 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NeflP08551 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NeflP08551 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms