Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ApoeP08226 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApoeP08226 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms