Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr1P08046 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms