Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04213 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04213 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04213 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04213 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04213 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04213 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04213 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04213 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms