Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tgfb1P04202 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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