Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01636 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01636 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01636 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01636 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01636 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01636 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01636 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01636 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01636 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01636 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01636 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01636 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01636 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01636 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01636 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms