Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms