Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BlmO88700 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BlmO88700 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BlmO88700 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BlmO88700 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BlmO88700 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BlmO88700 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BlmO88700 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BlmO88700 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BlmO88700 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BlmO88700 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BlmO88700 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BlmO88700 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BlmO88700 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BlmO88700 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BlmO88700 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BlmO88700 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BlmO88700 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BlmO88700 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BlmO88700 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BlmO88700 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BlmO88700 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BlmO88700 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BlmO88700 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms