Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ComtO88587 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ComtO88587 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ComtO88587 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ComtO88587 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ComtO88587 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ComtO88587 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ComtO88587 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ComtO88587 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ComtO88587 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ComtO88587 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms