Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col5a1O88207 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms