Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtssO70370 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtssO70370 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms