Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf5O70191 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms