Protein–RNA interactions for Protein: O70165

Fcn1, Ficolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcn1O70165 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcn1O70165 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcn1O70165 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms