Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms