Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms